A história inicia-se na Floresta Toadri(Toadri Forest), localizada no reino de Shyrule. Ela é habitada pelos ShyGuyri , espíritos guardiões da floresta, seres similares a shyguys, que moram em árvores e nunca se tornam adultos. Além disso, quando atingem uma determinada idade recebem da Grande Árvore Deku (Deku Tree) uma mosca-guia. Dentre os Shyguyri, Shyguy(seu verdadeiro nome é shy link) era o único que ainda não possuía uma mosca.
